Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO6Q96DC7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMCO6Q96DC7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO6Q96DC7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO6Q96DC7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms