Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4DQ92854 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA4DQ92854 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA4DQ92854 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA4DQ92854 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA4DQ92854 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms