Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DDX17Q92841 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DDX17Q92841 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
DDX17Q92841 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DDX17Q92841 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DDX17Q92841 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
DDX17Q92841 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DDX17Q92841 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
DDX17Q92841 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms