Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ7

ABCA5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA5Q8WWZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCA5Q8WWZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ABCA5Q8WWZ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.69■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.58
ABCA5Q8WWZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
ABCA5Q8WWZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ABCA5Q8WWZ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
ABCA5Q8WWZ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
ABCA5Q8WWZ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ABCA5Q8WWZ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
ABCA5Q8WWZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
ABCA5Q8WWZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCA5Q8WWZ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCA5Q8WWZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCA5Q8WWZ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCA5Q8WWZ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCA5Q8WWZ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCA5Q8WWZ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCA5Q8WWZ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCA5Q8WWZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms