Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC107Q8WV48 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC107Q8WV48 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC107Q8WV48 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms