Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA94

ZNF563, Zinc finger protein 563, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF563Q8TA94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF563Q8TA94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF563Q8TA94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF563Q8TA94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF563Q8TA94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF563Q8TA94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF563Q8TA94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF563Q8TA94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF563Q8TA94 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF563Q8TA94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF563Q8TA94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF563Q8TA94 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms