Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COLGALT1Q8NBJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COLGALT1Q8NBJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COLGALT1Q8NBJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms