Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POMGNT2Q8NAT1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POMGNT2Q8NAT1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POMGNT2Q8NAT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMGNT2Q8NAT1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms