Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO39Q8N4B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FBXO39Q8N4B4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO39Q8N4B4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO39Q8N4B4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO39Q8N4B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO39Q8N4B4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms