Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LTBP4Q8N2S1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
LTBP4Q8N2S1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LTBP4Q8N2S1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LTBP4Q8N2S1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LTBP4Q8N2S1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LTBP4Q8N2S1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LTBP4Q8N2S1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LTBP4Q8N2S1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LTBP4Q8N2S1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LTBP4Q8N2S1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LTBP4Q8N2S1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
LTBP4Q8N2S1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
LTBP4Q8N2S1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
LTBP4Q8N2S1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms