Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM15Q7Z3B0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM15Q7Z3B0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM15Q7Z3B0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms