Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX8Q6ZV50 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX8Q6ZV50 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RFX8Q6ZV50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX8Q6ZV50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX8Q6ZV50 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX8Q6ZV50 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX8Q6ZV50 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX8Q6ZV50 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX8Q6ZV50 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms