Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC171Q6TFL3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC171Q6TFL3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC171Q6TFL3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC171Q6TFL3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC171Q6TFL3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC171Q6TFL3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms