Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6Q795 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6Q795 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6Q795 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6Q795 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6Q795 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6Q795 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6Q795 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6Q795 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6Q795 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Q6Q795 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6Q795 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6Q795 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6Q795 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6Q795 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6Q795 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6Q795 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6Q795 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6Q795 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6Q795 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6Q795 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6Q795 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6Q795 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6Q795 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6Q795 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6Q795 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6Q795 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6Q795 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6Q795 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6Q795 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6Q795 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6Q795 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6Q795 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6Q795 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6Q795 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6Q795 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6Q795 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6Q795 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6Q795 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6Q795 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6Q795 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6Q795 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6Q795 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6Q795 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6Q795 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6Q795 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6Q795 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6Q795 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6Q795 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6Q795 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6Q795 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6Q795 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6Q795 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6Q795 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6Q795 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6Q795 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6Q795 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6Q795 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6Q795 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6Q795 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6Q795 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6Q795 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6Q795 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6Q795 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6Q795 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6Q795 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6Q795 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6Q795 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6Q795 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6Q795 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6Q795 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6Q795 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6Q795 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6Q795 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6Q795 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6Q795 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6Q795 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6Q795 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6Q795 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6Q795 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6Q795 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6Q795 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6Q795 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6Q795 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms