Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM53Q6P2H8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM53Q6P2H8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM53Q6P2H8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM53Q6P2H8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM53Q6P2H8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms