Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM225Q6GV28 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TMEM225Q6GV28 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM225Q6GV28 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM225Q6GV28 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM225Q6GV28 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms