Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MLIPQ5VWP3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MLIPQ5VWP3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLIPQ5VWP3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MLIPQ5VWP3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms