Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCP2LQ5T4T6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2LQ5T4T6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP2LQ5T4T6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2LQ5T4T6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms