Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATAD3CQ5T2N8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3CQ5T2N8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3CQ5T2N8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3CQ5T2N8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms