Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC3LQ5T215 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TRAPPC3LQ5T215 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC3LQ5T215 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC3LQ5T215 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC3LQ5T215 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC3LQ5T215 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC3LQ5T215 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC3LQ5T215 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAPPC3LQ5T215 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC3LQ5T215 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC3LQ5T215 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC3LQ5T215 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC3LQ5T215 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms