Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MS4A13Q5J8X5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MS4A13Q5J8X5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MS4A13Q5J8X5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A13Q5J8X5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms