Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL12Q53G59 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL12Q53G59 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL12Q53G59 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL12Q53G59 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL12Q53G59 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL12Q53G59 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms