Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSF3Q4G176 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSF3Q4G176 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSF3Q4G176 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSF3Q4G176 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSF3Q4G176 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSF3Q4G176 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms