Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NBPF8Q3BBV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NBPF8Q3BBV2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NBPF8Q3BBV2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NBPF8Q3BBV2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NBPF8Q3BBV2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NBPF8Q3BBV2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms