Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSMPQ1L6U9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMPQ1L6U9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMPQ1L6U9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMPQ1L6U9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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