Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
DUSP6Q16828 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUSP6Q16828 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DUSP6Q16828 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP6Q16828 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP6Q16828 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP6Q16828 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP6Q16828 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP6Q16828 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP6Q16828 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP6Q16828 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP6Q16828 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP6Q16828 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DUSP6Q16828 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP6Q16828 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP6Q16828 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP6Q16828 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP6Q16828 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP6Q16828 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP6Q16828 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP6Q16828 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUSP6Q16828 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DUSP6Q16828 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP6Q16828 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP6Q16828 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
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