Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRY1Q16526 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRY1Q16526 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRY1Q16526 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRY1Q16526 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRY1Q16526 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms