Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1EQ15878 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1EQ15878 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1EQ15878 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1EQ15878 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms