Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP10Q15642 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP10Q15642 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP10Q15642 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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