Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18Q15532 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18Q15532 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18Q15532 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18Q15532 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18Q15532 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18Q15532 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18Q15532 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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SS18Q15532 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SS18Q15532 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SS18Q15532 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SS18Q15532 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SS18Q15532 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SS18Q15532 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SS18Q15532 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SS18Q15532 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SS18Q15532 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SS18Q15532 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SS18Q15532 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SS18Q15532 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SS18Q15532 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SS18Q15532 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SS18Q15532 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SS18Q15532 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SS18Q15532 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SS18Q15532 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SS18Q15532 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SS18Q15532 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SS18Q15532 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SS18Q15532 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SS18Q15532 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SS18Q15532 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SS18Q15532 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SS18Q15532 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SS18Q15532 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SS18Q15532 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SS18Q15532 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18Q15532 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18Q15532 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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