Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264 ms