Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN5AQ14524 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN5AQ14524 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN5AQ14524 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN5AQ14524 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN5AQ14524 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN5AQ14524 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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