Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL49Q13405 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL49Q13405 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL49Q13405 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL49Q13405 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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