Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms