Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.346e-8■■■■■ 47.2
TARDBPQ13148 NUMBL-210ENST00000600636 555 ntTSL 416.14■□□□□ 0.176e-8■■■■■ 47.2
TARDBPQ13148 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 47.2
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TARDBPQ13148 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 218.51■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 47.2
TARDBPQ13148 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 216.94■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 47.2
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TARDBPQ13148 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 47.2
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TARDBPQ13148 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 47.2
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TARDBPQ13148 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.612e-9■■■■■ 47.2
TARDBPQ13148 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-12■■■■■ 47.1
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TARDBPQ13148 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.262e-12■■■■■ 46.4
TARDBPQ13148 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 46.4
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TARDBPQ13148 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 322.78■■□□□ 1.245e-11■■■■■ 46.3
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TARDBPQ13148 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.085e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 521.6■■□□□ 1.055e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.035e-11■■■■■ 46.3
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