RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528426.5

CHID1-212, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHID1, Length 991 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-212ENST00000528426 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.76■■■■■ 8.76
CHID1-212ENST00000528426 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.98■■■■■ 7.51
CHID1-212ENST00000528426 ABCC9O60706 1549 aa60.86■■■■■ 7.33
CHID1-212ENST00000528426 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.5■■■■■ 6.95
CHID1-212ENST00000528426 NACADO15069 1562 aa58.44■■■■■ 6.95
CHID1-212ENST00000528426 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.41■■■■■ 6.94
CHID1-212ENST00000528426 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.11■■■■■ 6.89
CHID1-212ENST00000528426 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.04■■■■■ 6.88
CHID1-212ENST00000528426 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.77■■■■■ 6.84
CHID1-212ENST00000528426 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.96■■■■■ 6.71
CHID1-212ENST00000528426 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.93■■■■■ 6.7
CHID1-212ENST00000528426 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.7■■■■■ 6.67
CHID1-212ENST00000528426 SCRIBQ14160 1630 aa56.48■■■■■ 6.63
CHID1-212ENST00000528426 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.21■■■■■ 6.59
CHID1-212ENST00000528426 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.14■■■■■ 6.58
CHID1-212ENST00000528426 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.23■■■■■ 6.43
CHID1-212ENST00000528426 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.02■■■■■ 6.4
CHID1-212ENST00000528426 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.76■■■■■ 6.36
CHID1-212ENST00000528426 SMARCA4P51532 1647 aa54.08■■■■■ 6.25
CHID1-212ENST00000528426 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.07■■■■■ 6.25
CHID1-212ENST00000528426 NCAPD3P42695 1498 aa54.01■■■■■ 6.24
CHID1-212ENST00000528426 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.94■■■■■ 6.23
CHID1-212ENST00000528426 SMARCA2P51531 1590 aa53.84■■■■■ 6.21
CHID1-212ENST00000528426 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.71■■■■■ 6.19
CHID1-212ENST00000528426 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.64■■■■■ 6.18
CHID1-212ENST00000528426 HMGXB3Q12766 1538 aa53.6■■■■■ 6.17
CHID1-212ENST00000528426 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.44■■■■■ 6.15
CHID1-212ENST00000528426 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.12■■■■■ 6.09
CHID1-212ENST00000528426 WIZO95785 1651 aa53.05■■■■■ 6.08
CHID1-212ENST00000528426 NESP48681 1621 aa52.6■■■■■ 6.01
CHID1-212ENST00000528426 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.55■■■■■ 6
CHID1-212ENST00000528426 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.5■■■■■ 5.99
CHID1-212ENST00000528426 ERCC6Q03468 1493 aa52.5■■■■■ 5.99
CHID1-212ENST00000528426 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.42■■■■■ 5.98
CHID1-212ENST00000528426 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.25■■■■■ 5.96
CHID1-212ENST00000528426 CUX2O14529 1486 aa52.06■■■■■ 5.92
CHID1-212ENST00000528426 CFTRP13569 1480 aa52.04■■■■■ 5.92
CHID1-212ENST00000528426 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.99■■■■■ 5.91
CHID1-212ENST00000528426 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.85■■■■■ 5.89
CHID1-212ENST00000528426 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.79■■■■■ 5.88
CHID1-212ENST00000528426 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.73■■■■■ 5.87
CHID1-212ENST00000528426 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.66■■■■■ 5.86
CHID1-212ENST00000528426 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.63■■■■■ 5.86
CHID1-212ENST00000528426 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.63■■■■■ 5.86
CHID1-212ENST00000528426 WDR62O43379 1518 aa51.43■■■■■ 5.82
CHID1-212ENST00000528426 PRDM2Q13029 1718 aa51.36■■■■■ 5.81
CHID1-212ENST00000528426 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.79
CHID1-212ENST00000528426 ABCC8Q09428 1581 aa50.96■■■■■ 5.75
CHID1-212ENST00000528426 TOPBP1Q92547 1522 aa50.87■■■■■ 5.73
CHID1-212ENST00000528426 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.78■■■■■ 5.72
CHID1-212ENST00000528426 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.76■■■■■ 5.72
CHID1-212ENST00000528426 IFT140Q96RY7 1462 aa50.65■■■■■ 5.7
CHID1-212ENST00000528426 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.43■■■■■ 5.66
CHID1-212ENST00000528426 CUX1P39880 1505 aa50.39■■■■■ 5.66
CHID1-212ENST00000528426 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.36■■■■■ 5.65
CHID1-212ENST00000528426 SOGA1O94964 1423 aa50.29■■■■■ 5.64
CHID1-212ENST00000528426 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.28■■■■■ 5.64
CHID1-212ENST00000528426 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.26■■■■■ 5.64
CHID1-212ENST00000528426 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.2■■■■■ 5.63
CHID1-212ENST00000528426 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.1■■■■■ 5.611e-6■■■■■ 31.4
CHID1-212ENST00000528426 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.07■■■■■ 5.61
CHID1-212ENST00000528426 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
CHID1-212ENST00000528426 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
CHID1-212ENST00000528426 OSCARQ8IYS5 282 aa50■■■■■ 5.59
CHID1-212ENST00000528426 WDR97A6NE52 1622 aa49.93■■■■■ 5.58
CHID1-212ENST00000528426 TOP2BQ02880 1626 aa49.92■■■■■ 5.58
CHID1-212ENST00000528426 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.86■■■■■ 5.57
CHID1-212ENST00000528426 SYNJ1O43426 1573 aa49.83■■■■■ 5.57
CHID1-212ENST00000528426 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.82■■■■■ 5.57
CHID1-212ENST00000528426 GRIN2BQ13224 1484 aa49.69■■■■■ 5.55
CHID1-212ENST00000528426 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.67■■■■■ 5.54
CHID1-212ENST00000528426 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.57■■■■■ 5.53
CHID1-212ENST00000528426 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.57■■■■■ 5.53
CHID1-212ENST00000528426 FBLN2P98095 1184 aa49.56■■■■■ 5.52
CHID1-212ENST00000528426 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.52■■■■■ 5.52
CHID1-212ENST00000528426 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.47■■■■■ 5.51
CHID1-212ENST00000528426 CHD1O14646 1710 aa49.4■■■■■ 5.5
CHID1-212ENST00000528426 SYNJ2O15056 1496 aa49.38■■■■■ 5.5
CHID1-212ENST00000528426 PBRM1Q86U86 1689 aa49.36■■■■■ 5.49
CHID1-212ENST00000528426 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.21■■■■■ 5.47
CHID1-212ENST00000528426 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.13■■■■■ 5.46
CHID1-212ENST00000528426 KIF27Q86VH2 1401 aa49.08■■■■■ 5.45
CHID1-212ENST00000528426 ADAMTS12P58397 1594 aa49.05■■■■■ 5.44
CHID1-212ENST00000528426 GRIN2AQ12879 1464 aa49.02■■■■■ 5.44
CHID1-212ENST00000528426 ARHGEF11O15085 1522 aa49■■■■■ 5.43
CHID1-212ENST00000528426 CLASP1Q7Z460 1538 aa49■■■■■ 5.43
CHID1-212ENST00000528426 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.96■■■■■ 5.43
CHID1-212ENST00000528426 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.96■■■■■ 5.43
CHID1-212ENST00000528426 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.96■■■■■ 5.43
CHID1-212ENST00000528426 IGF1RP08069 1367 aa48.95■■■■■ 5.43
CHID1-212ENST00000528426 TRIM41Q8WV44 630 aa48.91■■■■■ 5.42
CHID1-212ENST00000528426 NUP160Q12769 1436 aa48.85■■■■■ 5.41
CHID1-212ENST00000528426 CEP170Q5SW79 1584 aa48.71■■■■■ 5.39
CHID1-212ENST00000528426 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.68■■■■■ 5.38
CHID1-212ENST00000528426 CUL7Q14999 1698 aa48.64■■■■■ 5.38
CHID1-212ENST00000528426 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.64■■■■■ 5.38
CHID1-212ENST00000528426 ARAP1Q96P48 1450 aa48.6■■■■■ 5.37
CHID1-212ENST00000528426 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.49■■■■■ 5.35
CHID1-212ENST00000528426 JPH4Q96JJ6 628 aa48.46■■■■■ 5.35
CHID1-212ENST00000528426 SHROOM2Q13796 1616 aa48.4■■■■■ 5.34
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