Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms