Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CPSF1Q10570 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CPSF1Q10570 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CPSF1Q10570 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CPSF1Q10570 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CPSF1Q10570 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CPSF1Q10570 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CPSF1Q10570 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CPSF1Q10570 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CPSF1Q10570 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
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