Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC15Q0P6D6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC15Q0P6D6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC15Q0P6D6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms