Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXM1Q08050 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXM1Q08050 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXM1Q08050 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXM1Q08050 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXM1Q08050 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms