Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN1BQ07699 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN1BQ07699 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN1BQ07699 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN1BQ07699 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.3 ms