Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK18Q07002 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK18Q07002 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK18Q07002 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK18Q07002 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK18Q07002 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms