Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNEQ04844 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNEQ04844 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNEQ04844 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNEQ04844 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms