Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAP1Q01518 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAP1Q01518 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAP1Q01518 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAP1Q01518 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CAP1Q01518 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAP1Q01518 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAP1Q01518 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAP1Q01518 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAP1Q01518 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CAP1Q01518 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAP1Q01518 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAP1Q01518 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms