Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-225ENST00000569063 833 ntTSL 519.46■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-221ENST00000568139 918 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-210ENST00000563112 665 ntTSL 316.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-217ENST00000566126 732 ntTSL 514.93□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-211ENST00000563297 526 ntTSL 414.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-223ENST00000568488 481 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-204ENST00000483723 1749 ntTSL 214.04□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-209ENST00000562670 544 ntTSL 413.8□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-203ENST00000454830 3787 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-214ENST00000564096 805 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-224ENST00000568605 1047 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CLK3-226ENST00000569406 3591 ntTSL 210.23□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.858e-7■■■■■ 33.6
TIAL1Q01085 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.639e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.519e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.389e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SEPT2-211ENST00000421717 818 ntTSL 416.77■□□□□ 0.289e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.599e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.659e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.879e-12■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)25.67■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 525.58■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 33.5
TIAL1Q01085 SLC17A1-202ENST00000377886 1433 ntTSL 510.12□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 SLC17A1-201ENST00000244527 1844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.993e-10■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.113e-10■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 A2M-213ENST00000546069 593 ntTSL 56.75□□□□□ -1.333e-10■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 MAPK13-204ENST00000476951 499 ntTSL 35.93□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 MBNL2-205ENST00000449284 581 ntTSL 25.91□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.73e-10■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-210ENST00000520076 570 ntTSL 419.34■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-205ENST00000518419 567 ntTSL 418.14■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-222ENST00000523361 540 ntTSL 511.53□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-203ENST00000517450 550 ntTSL 411.52□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-225ENST00000524339 811 ntTSL 211.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-219ENST00000522520 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-207ENST00000519464 1006 ntTSL 510.16□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-223ENST00000523431 784 ntTSL 510.16□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-202ENST00000517353 841 ntTSL 39.9□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-214ENST00000521287 772 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-215ENST00000521742 614 ntTSL 36.26□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-211ENST00000520604 664 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-212ENST00000520635 882 ntTSL 54.42□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 ZFAND1-224ENST00000524305 2719 ntTSL 22.45□□□□□ -2.022e-7■■■■■ 33.4
TIAL1Q01085 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.611e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.541e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 322.83■■□□□ 1.251e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.991e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MESD-202ENST00000422879 1392 ntTSL 216.27■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 314.74□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.41e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 C2orf72-202ENST00000463834 3141 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MESD-207ENST00000619987 3978 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.761e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MESD-203ENST00000559537 539 ntTSL 49.98□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MESD-204ENST00000560189 936 ntTSL 59.05□□□□□ -0.961e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 MESD-205ENST00000560244 981 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-9■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 33.3
TIAL1Q01085 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 PARN-213ENST00000564904 468 ntTSL 53.63□□□□□ -1.832e-8■■■■■ 33.2
TIAL1Q01085 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 25e-18■■■■■ 33.1
TIAL1Q01085 JUND-202ENST00000600972 500 ntTSL 225.23■■□□□ 1.635e-18■■■■■ 33.1
TIAL1Q01085 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 33.1
TIAL1Q01085 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 33.1
TIAL1Q01085 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 33.1
TIAL1Q01085 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 215.94■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 33
TIAL1Q01085 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-9■■■■■ 33
TIAL1Q01085 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-9■■■■■ 33
TIAL1Q01085 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 527.43■■□□□ 1.985e-10■■■■■ 32.7
TIAL1Q01085 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.895e-10■■■■■ 32.7
TIAL1Q01085 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-10■■■■■ 32.7
TIAL1Q01085 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-10■■■■■ 32.7
TIAL1Q01085 RBM39-236ENST00000490484 871 ntTSL 59.87□□□□□ -0.835e-9■■■■■ 32.7
TIAL1Q01085 RBM39-239ENST00000494274 704 ntTSL 36.93□□□□□ -1.35e-9■■■■■ 32.7
TIAL1Q01085 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.433e-9■■■■■ 32.4
TIAL1Q01085 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.393e-9■■■■■ 32.4
TIAL1Q01085 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 32.4
TIAL1Q01085 PMS1-211ENST00000424766 831 ntTSL 320.13■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 32.4
TIAL1Q01085 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 32.4
TIAL1Q01085 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 32.4
TIAL1Q01085 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 32.4
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 241.1 ms