Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS18P62269 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS18P62269 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS18P62269 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS18P62269 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS18P62269 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS18P62269 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS18P62269 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS18P62269 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS18P62269 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS18P62269 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS18P62269 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS18P62269 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS18P62269 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS18P62269 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS18P62269 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS18P62269 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS18P62269 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS18P62269 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS18P62269 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS18P62269 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS18P62269 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS18P62269 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS18P62269 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS18P62269 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS18P62269 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS18P62269 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS18P62269 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS18P62269 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS18P62269 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS18P62269 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS18P62269 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS18P62269 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS18P62269 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS18P62269 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS18P62269 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS18P62269 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS18P62269 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS18P62269 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS18P62269 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS18P62269 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS18P62269 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS18P62269 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS18P62269 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS18P62269 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS18P62269 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS18P62269 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS18P62269 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS18P62269 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS18P62269 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS18P62269 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS18P62269 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS18P62269 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS18P62269 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS18P62269 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS18P62269 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS18P62269 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS18P62269 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS18P62269 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS18P62269 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS18P62269 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS18P62269 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS18P62269 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS18P62269 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS18P62269 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS18P62269 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS18P62269 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS18P62269 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS18P62269 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS18P62269 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS18P62269 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS18P62269 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS18P62269 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS18P62269 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS18P62269 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS18P62269 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS18P62269 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS18P62269 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS18P62269 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS18P62269 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS18P62269 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS18P62269 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS18P62269 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS18P62269 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms