Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPS1P60891 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPS1P60891 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPS1P60891 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPS1P60891 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms