Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FCGRTP55899 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FCGRTP55899 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FCGRTP55899 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FCGRTP55899 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FCGRTP55899 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FCGRTP55899 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FCGRTP55899 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FCGRTP55899 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms