Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI2P50395 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI2P50395 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI2P50395 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDI2P50395 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI2P50395 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI2P50395 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI2P50395 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDI2P50395 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI2P50395 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI2P50395 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDI2P50395 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDI2P50395 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDI2P50395 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDI2P50395 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDI2P50395 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDI2P50395 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDI2P50395 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDI2P50395 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDI2P50395 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDI2P50395 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDI2P50395 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GDI2P50395 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDI2P50395 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDI2P50395 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDI2P50395 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDI2P50395 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDI2P50395 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDI2P50395 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDI2P50395 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDI2P50395 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDI2P50395 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDI2P50395 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDI2P50395 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDI2P50395 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDI2P50395 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDI2P50395 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDI2P50395 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDI2P50395 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI2P50395 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI2P50395 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI2P50395 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI2P50395 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI2P50395 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI2P50395 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDI2P50395 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI2P50395 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI2P50395 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI2P50395 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI2P50395 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI2P50395 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI2P50395 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI2P50395 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI2P50395 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI2P50395 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI2P50395 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI2P50395 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI2P50395 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI2P50395 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI2P50395 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI2P50395 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI2P50395 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI2P50395 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI2P50395 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI2P50395 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI2P50395 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI2P50395 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI2P50395 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI2P50395 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDI2P50395 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDI2P50395 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDI2P50395 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDI2P50395 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDI2P50395 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDI2P50395 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDI2P50395 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDI2P50395 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDI2P50395 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDI2P50395 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDI2P50395 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDI2P50395 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDI2P50395 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDI2P50395 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDI2P50395 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDI2P50395 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDI2P50395 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms