Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSEN1P49768 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSEN1P49768 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PSEN1P49768 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSEN1P49768 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSEN1P49768 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms